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《二师兄聊磁珠2》之磁珠法核酸提取那点事儿9、同时进行上百个全血裂解样本时,可以直接用烘箱操作吗?

发布日期:2018-11-28信息来源: 《二师兄聊磁珠2》磁珠法核酸提取那点事儿篇章点击率:

同时进行上百个全血裂解样本时,可以直接用烘箱操作吗?

      大家好,有朋友在咨询高通量磁珠法DNA提取的时候,同时操作上百个样本这个时候,不想用水浴锅裂解,想用烘箱裂解可以吗?毕竟水浴锅裂解拿来拿去滴滴答答不好操作,对于能否用烘箱裂解代替水浴锅裂解,我们的回答是完全可以的,在我们英芮诚核酸提取外包服务做了非常多的全血基因组的提取,每天可以做到上万个,在这个时候裂解可以分为两种方式:一种是烘箱裂解;另外一种是水浴锅裂解。

      现在我们已经逐步替换成了我们英芮诚自主研发的动态金属浴来进行裂解,虽然在全血或者说是其他样本裂解的时候会有多种不同的裂解方式,我们不仅要知其然,也要知其所以然。裂解就是给它一个温度让蛋白酶K来发挥作用,使白细胞裂解。在这个过程中无论是使用水浴锅,金属浴或者是烘箱,都是完全没有问题的。

      但是如果同时进行上百个样本的提取,将血液放在96孔板里面进行直接提取,如果用烘箱进行操作,需要注意几个问题,首先用水浴锅进行操作,因为是水浴,传热比较均匀,如果用烘箱来完成裂解,在烘箱中是干温裂解,不会影响采血管,EP管外部的标签掉落,对后续实验的完成比较有利。烘箱裂解并不是说把采血管,EP管放在烘箱里面进行裂解就不管了。这里需要特别注意几点,这些问题在水浴裂解也会出现。第一不论是在采血管或者是EP管里进行裂解,裂解管上的空气部分会随着温度的升高而膨胀,使裂解管中的压力升高。会导致采血管管帽或者EP管的盖子崩开。烘箱裂解是内部空气流动,内部气溶胶增加。高温使采血管管帽或者EP管的盖子崩开,进而引起交叉污染。这是一个最大的问题。第二,烘箱里的裂解属于静态的恒温裂解,如果是大体积样本,收集到的白细胞会比较多,会出现分散不均匀,裂解不充分的情况。第三,烘箱裂解是靠空气传导的,传导效率比水浴锅和金属浴的略低,因为是空气传导温度梯度比较明显,裂解效率会差一点。

       总结一下烘箱裂解会出现三个问题:

第一管子会崩开或者采血管管帽、EP管的盖子崩开,烘箱内部气溶胶,引起交叉污染的可能性。

第二,烘箱属于静态的恒温裂解,会出现裂解不均匀的情况。

第三,烘箱是通过空气传导的,前期温度梯度的会比较大。

      针对这些问题,英芮诚是怎么解决的呢?第一我们自主研发了一款特殊的夹具,因为大体积血我们是直接在采血管里裂解的,收集完细胞,直接在采血管里裂解,效率会比较高。为了避免采血管的管帽的崩开,我们自主研发了特殊的夹具,因为我们有自主开发的仪器,有这方面的经验。这个夹具既能释放采血管内部温度升高带来的上面的气体压力,同时也避免了采血管管帽崩开的导致气溶胶的污染。第二为了解决静态恒温裂解这个问题,建议在烘箱裂解一段时间之后拿出来冷却一下进行上下颠倒,要让采血管或者EP管里的裂解液混合均匀。第三考虑到烘箱属于空气传导,它的传导效率比较低,建议把烘箱温度设高一点,建议65°左右,同时延长裂解时间20-30分钟。并且每10-20分钟取出涡旋混匀。这样就解决了裂解不充分,裂解不均匀的问题。有些客户没有我们英芮诚的特殊夹具,那么这边有一些比较简单的方法。对于采血管来说 拿盛放采血管的白色的泡沫板上下夹住采血管上面垫上一块硬纸板,拿乳胶管固定上下颠倒,也能起到一定的作用。这是一个比较简洁的办法。如果是96孔板的话会带来一些新的问题,96孔板一种是用膜封住,膜遇热容易崩开也会导致孔与孔之间的交叉污染。对于96孔板里的样本,将样本放到96孔板里做,样本做的会比较多,高通量。建议使用我们英芮诚自主研发的高通量的动态加热裂解仪。我们现在自己操作的是同时可以操作896孔板。加热,震荡,裂解。如果有需要的朋友可以咨询我们的销售工程师或者在我们的官网上进行查询。针对96孔板可以动态加热,能够长期升温,温度是可以调节的,这种装置不仅可以96孔板也可以EP管的,我们都有匹配的装置。对于全血裂解同时操作上百个样本用烘箱是完全可以的。只是我们要规避烘箱裂解的可能潜在的几个问题。所有问题都是避免两个 一个交叉污染,第二裂解不均匀。谢谢大家。

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